Il Parco nazionale Isla Contoy è stato istituito per decreto nel 1998 all'estremità settentrionale del Quintana Roo, dove il mar dei Caraibi incontra il golfo del Messico, una trentina di chilometri a nord di Isla Mujeres. È un'isola stretta e allungata, lunga appena otto chilometri circa, disabitata e con accesso molto limitato: il numero di visitatori giornalieri è contingentato e lo sbarco è consentito solo in un settore preciso.
Il suo valore principale è ornitologico. Contoy è uno dei siti di nidificazione di uccelli marini più importanti dei Caraibi messicani, con folte colonie di fregata magnifica, pellicano bruno, cormorano e diverse specie di sterne e aironi; sull'isola sono state segnalate più di centocinquanta specie di uccelli tra stanziali e migratori. Le sue spiagge sono inoltre zona di nidificazione delle tartarughe marine, soprattutto la tartaruga embricata e la tartaruga verde.
L'isolotto riunisce spiagge, dune, mangrovie e lagune costiere interne in pochissimo spazio, il che spiega la varietà di uccelli che ospita. Le acque circostanti fanno parte dell'area in cui ogni estate si concentra una delle più grandi aggregazioni di squali balena al mondo, attratti dalle deposizioni di massa delle uova dei pesci, un fenomeno che ha dato vita a un'attività turistica regolamentata. La vicinanza a Cancún e a Isla Mujeres fa della gestione dell'afflusso di visitatori la sfida principale del parco.
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